Filtreler, esasen bir elek ile aynı şekilde çalışır ve suyun geçmesine izin verirken, parçacıkların geçişine gözenek boyutuna bağlı olarak fiziksel bir bariyer sağlar. Ön işlem, büyük partikülleri gidermek için 1 ila 100 mikron arasında değişen gözenek boyutlarına sahip bir veya daha fazla filtre içerebilir, ancak saflaştırma sistemi içinde, ince partiküller, kolloidler ve bakteri - mikro gözenekli filtreler (0,05 ila 0,22 mikron) veya ultra filtreler (0,001 ila 0,01 mikron).