Temizleme yüzeylerden ya da nesnelerden kiri, tozu, kırıntıyı ve mikrobu ayıklarken, sanitasyon da ise hijyen için gerekli olan koşulların sağlanması ve korunması yani halk sağlığı koşullarını ifade etmektedir. Temizlik işleminde su, sabun ve de deterjan kullanılmaktadır. Bu işlem mikropların mutlak şekilde ölümüne neden olmamaktadır. Sadece bazılarını ortamdan uzaklaştırma kabiliyeti gösterdiğinden insanı hasta edecek mikrop bırakmaz. Sanitasyonda da mikropların sayısı güvenli seviyeye düşünülmektedir.

Dezenfekte etmek konusu için de bir yüzey ya da nesne dezenfektanlar ile mikroplardan arındırılmaktadır. Yüksek hijyen isteyen durumlarda mesela bir ameliyat öncesi ameliyathanelerin ve de ameliyat malzemelerinin dezenfekte etme şartı aranmaktadır. Böylece yüksek enfeksiyon riski taşıyan durumlar ve alanlar dezenfekte edilerek mikroplardan tamamen kurtulmaktadır. Dezenfekte işleminde kullanılacak dezenfektanın neye karşı etkili olduğu da bu durumda büyük önem taşımaktadır.