Zararlı mikroorganizmalar, çeşitli kaynaklardan suya bulaşabilir. Bunlar arasında atık su deşarjları, tarımsal faaliyetler, endüstriyel atıklar ve hayvan atıkları bulunabilir. Bu mikroorganizmalar arasında bakteriler, virüsler, protozoalar ve parazitler yer alır. Bu mikroorganizmalar, sulara bulaştıklarında ciddi sağlık sorunlarına neden olabilirler. Özellikle ishal, kusma, karın ağrısı, enfeksiyonlar ve bağışıklık sistemi sorunları gibi rahatsızlıklara yol açabilirler.